爱捣鼓发明但始终不受狐狸镇长官待见的小狐狸，为了证明自己的价值，来到兔子镇“潜伏”，协助长官伺机盗取兔子镇的守护符，但他却渐渐被兔子们的善良真诚感染，高举起拯救兔子的义旗反戈一击。

根据三维动画电视系列剧《小狐狸发明记》改编的剧场版电影：小狐狸叮咚是狐狸镇上不受欢迎的发明家，因为虽然他的生活小发明妙趣横生，崇尚武力的狐狸们一点都不喜欢。一天，叮咚接受了一项神秘任务，去传说中邪恶的兔子镇盗取几百年前狐狸和兔子签订的拥有强大力量的契约，消灭死敌兔子们。辗转来到兔子镇，叮咚在兔子镇看到兔子们善良令人泪奔。

在执行“任务”的过程中，叮咚认识了许多朋友，包括史上最伟大发明家的发明兔的后代小八。这一对活宝好友炮制了一堆不大靠谱却帮助了很多人的发明。

狐狸叮咚在兔子镇找到了发明的意义，懂得了和平友爱的真谛，并深深爱上了这个美丽的小镇。但就 在此时，狐狸长官要毁灭兔子们的命令限期到了，叮咚和他的朋友们该如何对抗强大的狐狸？传说中的契约又究竟藏了什么秘密呢？